<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Ornamental Aquatics</title>
<title_fa>آبزیان زینتی</title_fa>
<short_title>Journal of Ornamental Aquatics</short_title>
<subject>Agriculture</subject>
<web_url>http://ornamentalaquatics.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-4575</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2423-4575</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/JOA</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1403</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2024</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقاله علمی – پژوهشی:‌ بررسی تنوع ژنتیکی شش گونه از ماهیان اقتصادی در منطقه خلیج فارس با استفاده از ژنوم 16SrRNA</title_fa>
	<title>Investigation of genetic diversity of six economically important fish species in the Persian Gulf region using 16S rRNA genome</title>
	<subject_fa>تخصصي</subject_fa>
	<subject>Special</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;کاهش ذخایر آبزیان در نقاط مختلف جهان موجب شده است که پژوهشگران علوم شیلاتی پیش از هر گونه اقدام عملی در راستای مدیریت ذخایر آبزیان اقتصادی، ماهیان زینتی و ماهیان جنگل&#8204;های مانگرو، به بررسی و تعیین ساختار ژنتیکی گونه&#8204;های با ارزش آن منطقه از طریق روش&#8204;های مولکولی بپردازند. بنابراین، شناخت ساختار ژنتیکی گونه&#8204;های مختلف اقتصادی خلیج فارس از جمله شش گونه مذکور، پیش از هرگونه اقدام عملی برای حفظ و افزایش این ذخایر ضروری به&#8204;نظر می&#8204;رسد&lt;/span&gt;.&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; در این پژوهش، نواحی خاصی از ژنوم میتوکندریایی&lt;/span&gt; (mtDNA)&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;به نام &lt;/span&gt;16SrDNA&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; با موفقیت تکثیر و تعیین توالی شد. در این فرآیند، حدود 650-600 جفت باز آمپلی&#8204;فای شده و بازهای قابل اعتماد از هر ژن برای بررسی فایلوژنی انتخاب گردیدند. نمونه&#8204;برداری از مناطق هدف که شامل اصلی&#8204;ترین زیستگاه&#8204;های منحصربه&#8204;فرد شش گونه مورد مطالعه در خلیج فارس است، انجام شد. این گونه&#8204;ها شامل راشگو معمولی&lt;/span&gt;(&lt;a name=&quot;_Hlk185612330&quot;&gt;&lt;em&gt;Eleutheronema&lt;/em&gt; &lt;em&gt;tetradactylum&lt;/em&gt;&lt;/a&gt;) &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;، صبیتی&lt;/span&gt;(&lt;a name=&quot;_Hlk185612420&quot;&gt;&lt;em&gt;Sparidentex&lt;/em&gt; &lt;em&gt;hasta&lt;/em&gt;&lt;/a&gt;) &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;، سنگسر معمولی &lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Pomadasys&lt;/em&gt; &lt;em&gt;kaakan&lt;/em&gt;)&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;، شوریده&lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Otolithes&lt;/em&gt; &lt;em&gt;ruber&lt;/em&gt;) &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;، میش ماهی منقوط &lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Protonibea&lt;/em&gt; &lt;em&gt;diacanthus&lt;/em&gt;)&amp;nbsp; &amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;و حلوا سفید&lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Pampus&lt;/em&gt; &lt;em&gt;argenteus&lt;/em&gt;) &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&amp;nbsp;می&#8204;باشند. این گونه&#8204;ها از مهم&#8204;ترین موجودات دریایی در این منطقه شناخته می&#8204;شوند و نمونه&#8204;برداری در زیستگاه&#8204;های طبیعی آنها صورت گرفت&lt;/span&gt;.&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; طبق روش استاندارد، از هر نمونه حداقل پنج قطعه از باله شنای گونه&#8204;های مورد مطالعه برای انجام تحلیل&#8204;های مولکولی و شناسایی دقیق گونه&#8204;ها جدا شد. در این تحقیق، گونه راشگو (&lt;/span&gt;&lt;em&gt;Eleutheronema&lt;/em&gt; &lt;em&gt;tetradactylum&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; ) به عنوان یک هاپلوتایپ مجزا در کنار نمونه&#8204;هایی از مالزی و جین در کلاید سوم به همراه نمونه&#8204;ای از میش ماهیان شناسایی گردید. همچنین نمونه&#8204;ای از میش&#8204;ماهی غالب (&lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Protonibea&lt;/em&gt; &lt;em&gt;diacanthus&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; در منطقه خوزستان در مقایسه با نمونه&#8204;ای از میش&#8204;ماهی معمولی &lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Argyrosomus&lt;/em&gt; &lt;em&gt;hololepidotus&lt;/em&gt;)&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; در استان هرمزگان مشاهده شد که نشان&#8204;دهنده غالب بودن گونه منقوط در غرب خلیج فارس نسبت به گونه میش&#8204;ماهی معمولی &lt;/span&gt;(&lt;em&gt;Argyrosomus&lt;/em&gt; &lt;em&gt;hololepidotus&lt;/em&gt;)&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&amp;nbsp; در شرق خلیج فارس است&lt;/span&gt;.&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; اگر این فرضیه به اثبات برسد، می&#8204;توان این گونه را به عنوان یک&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;گونه&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;یا&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;مورفوتایپ&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;جدید و&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;اندمیک&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;منطقه خلیج فارس مورد بررسی قرار داد. این گونه به همراه ماهی شوریده، در قالب&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;کلاستر خواهری&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;با اختلاف یازده درصدی، به همراه نمونه&#8204;هایی از کشور هند، کلاید دوم را کامل می&#8204;کند. ماهی سنگسر معمولی با اختلاف بالاتری نسبت به پنج گونه مذکور دیگر، در کلاید اول قرار گرفت و اختلافی در بین نمونه&#8204;های این گونه از هرمزگان و خوزستان مشاهده نشد. اما این گونه با نمونه&#8204;ای از چین اختلاف نه درصدی را نشان داد که نمایانگر عدم مهاجرت و کاهش انتقال آلل&#8204;های بین جمعیتی است&lt;/span&gt; .&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;اگرچه این گونه با گونه حلوا سفید در همین کلاید با اختلاف دوازده درصدی و با گونه صبیتی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&amp;nbsp;با اختلاف چهارده درصدی کلاستر خواهری را نشان داد. این تحقیق نشان می&#8204;دهد که استفاده از توالی &lt;/span&gt;16SrDNA&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt; می&#8204;تواند اطلاعات ارزشمندی درباره ساختار جمعیتی ماهیان، روابط ژنتیکی بین گونه ها در منطقه خلیج فارس و وضعیت اکولوژیک این منابع فراهم کند. همچنین این یافته&#8204;ها می&#8204;توانند به مدیریت بهتر منابع آبزی و حفظ تنوع زیستی و برنامه&#8204;ریزی&#8204;های مدیریتی و حفاظتی کمک کنند&lt;/span&gt;.&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&quot;B Compset&quot;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:85%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,sans-serif&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:85%&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;The decline of aquatic resources in various parts of the world has prompted fisheries researchers to study and determine the genetic structure of valuable species in their regions using molecular methods before taking practical steps to manage economically important fish stocks, ornamental fish and mangrove forest fish. Therefore, understanding the genetic structure of various economically important species in the Persian Gulf, including the six mentioned species, appears to be essential before taking practical measures to conserve and improve these resources. This study examines specific regions of the mitochondrial genome (mtDNA), known as 16SrDNA, were successfully amplified and sequenced. Approximately 600 to 650 base pairs were amplified and reliable bases from each gene were selected for phylogenetic analysis. Sampling was conducted in target areas encompassing the key unique habitats of the six studied species in the Persian Gulf. Species include&amp;nbsp;&lt;i&gt;Eleutheronema&lt;/i&gt; &lt;i&gt;tetradactylum&lt;/i&gt;&amp;nbsp;(Rashgo),&amp;nbsp;&lt;i&gt;Sparidentex&lt;/i&gt; &lt;i&gt;hasta&lt;/i&gt;&amp;nbsp;(Sobiti),&amp;nbsp;&lt;i&gt;Pomadasys&lt;/i&gt; &lt;i&gt;kaakan&lt;/i&gt;&amp;nbsp; (Sangsar),&amp;nbsp;&lt;i&gt;Otolithes&lt;/i&gt; &lt;i&gt;ruber&lt;/i&gt;&amp;nbsp;(Shorideh),&amp;nbsp;&lt;i&gt;Protonibea&lt;/i&gt; &lt;i&gt;diacanthus&lt;/i&gt;&amp;nbsp;(Mish mahi manqoot), and&amp;nbsp;&lt;i&gt;Pampus&lt;/i&gt; &lt;i&gt;argenteus&lt;/i&gt;&amp;nbsp;(Halva sefid). These species are considered as some of the most important marine organisms in this region, and the sampling was carried out in their natural habitats. According to standard methods, at least five fin pieces of the fin from each specimen of the studied species were separated for molecular analysis and precise species identification. In this research,&amp;nbsp;&lt;i&gt;Eleutheronema&lt;/i&gt; &lt;i&gt;tetradactylum&lt;/i&gt;&amp;nbsp;was identified as a distinct haplotype alongside samples from Malaysia and China in Clyde III, along with a sample of&amp;nbsp;&lt;i&gt;Protonibea&lt;/i&gt; &lt;i&gt;diacanthus&lt;/i&gt;. In addition, a dominant sample of&amp;nbsp;&lt;i&gt;Protonibea&lt;/i&gt; &lt;i&gt;diacanthus&lt;/i&gt;&amp;nbsp;was observed in the Khuzestan region compared to a sample of the common mish mahi (&lt;i&gt;Argyrosomus&lt;/i&gt; &lt;i&gt;hololepidotus&lt;/i&gt;) in Hormozgan province, suggestion that the spotted species in the western Persian Gulf versus the common mish mahi in the eastern Persian Gulf. If this hypothesis is confirmed, this species can be considered a new and endemic species or morphotype of the Persian Gulf region. This species, along with the &lt;i&gt;Otolithes&lt;/i&gt; &lt;i&gt;ruber&lt;/i&gt;, completes the second clade with a divergence of eleven percent, alongside samples from India. The common pomfret (&lt;i&gt;Pomadasys&lt;/i&gt; &lt;i&gt;kaakan&lt;/i&gt;), with greater divergence compared to the other five mentioned species, was placed in the first clade, and no differences were observed among samples of this species from Hormozgan and Khuzestan. However, this species showed a nine percent divergence with a sample from China, indicating a lack of migration and reduced allele transfer between populations. Although this species exhibited a twelve percent divergence with the silver pomfret (&lt;i&gt;Pampus&lt;/i&gt; &lt;i&gt;argenteus&lt;/i&gt;) in the same clade, and a fourteen percent divergence with the &lt;i&gt;Sparidentex&lt;/i&gt; &lt;i&gt;hasta&lt;/i&gt;, indicating sister clustering. This research demonstrates that the use of 16SrDNA sequencing can provide valuable information about the population structure of fish, genetic relationships among species in the Persian Gulf region and the ecological status of these resources. Furthermore, these findings can aid in better management of aquatic resources and conservation planning efforts.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>تنوع ژنتیکی, خلیج فارس, PCR, mtDNA, 16SrDNA</keyword_fa>
	<keyword>Genetic diversity, Persian Gulf, PCR, mtDNA, 16SrDNA</keyword>
	<start_page>15</start_page>
	<end_page>23</end_page>
	<web_url>http://ornamentalaquatics.ir/browse.php?a_code=A-10-91-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>R.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nahavandi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نهاوندی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003146</code>
	<orcid>10031947532846003146</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Animal Science Research Institute of Iran (ASRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeed</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tammadoni Jahromi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>تمدنی جهرمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003147</code>
	<orcid>10031947532846003147</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Persian Gulf and Oman Sea Ecology Research Center, Iranian Fisheries Sciences Research Institute, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>پژوهشکده اکولوژی خلیج فارس و دریای عمان، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
